روزی امام فرمودند: «یکبار در حال رفتن به مدرسه فیضیه مشاهده کردم که عده ای دارند راجع به کتاب اسرار هزار ساله بحث می کنند، ناگهان به ذهنم آمد که ما داریم درس اخلاق می گوییم حال آنکه این بحثها در حوزه ها هم نفوذ پیدا کرده است.» لذا تصمیم می گیرند از وسط مدرسه فیضیه برگردند و دیگر به مدرسه نرفتند و طی یک ماه تا چهل روز تقریبا همه کارها را کنار گذاشتند و کتاب کشف اسرار را نوشتند.
منبع: برداشتهایی از سیره امام خمینی (ره)، جلد 4، صفحه 25.
راوی: سید احمد خمینی.